2010年02月28日

Chem関連URLリンク

chem系サイトを紹介してみたり

■描画系(構造図などを表示したり、編集したり)
Symyx (ISIS Draw/MDL Directなどの会社)
http://www.symyx.com/jp/index.html

ISIS Drawの登録
http://szksrv.isc.chubu.ac.jp/isisdraw/

JMol
http://jmol.sourceforge.net/

XDrawChem
http://ja.wikipedia.org/wiki/XDrawChem

JChemPaint(Java Appletで構造式を表示したり、編集したり)
http://sourceforge.net/apps/mediawiki/cdk/index.php?title=Main_Page
http://sourceforge.net/projects/cdk/files/cdk/

その他(Wikipedia:構造式エディタ)
http://ja.wikipedia.org/wiki/%E6%A7%8B%E9%80%A0%E5%BC%8F%E3%82%A8%E3%83%87%E3%82%A3%E3%82%BF


■計算ライブラリ(mol形式にして計算するのが普通なのかな?)

CDK(計算ライブラリや基本機能)
いつのまにか、LGPLになってる・・・
http://sourceforge.net/apps/mediawiki/cdk/index.php?title=Main_Page
http://sourceforge.net/projects/cdk/files/cdk/

JOELIB
http://sourceforge.jp/projects/sfnet_joelib/
http://sourceforge.jp/projects/freshmeat_joelib/

chemruby
http://chemruby.org/wiki/%E3%83%A1%E3%82%A4%E3%83%B3%E3%83%9A%E3%83%BC%E3%82%B8

bioruby
http://bioruby.open-bio.org/

pychem
http://pychem.sourceforge.net/

PerlMol
http://www.perlmol.org/

■ファイル形式変換

メーカーが研究者を囲い込もうと、独自の形式を困る困る。
そんなファイルを変換してくれる救世主!
GUI、コンソールベース、Javaインタフェースや.Netインターフェースまである。
http://openbabel.org/wiki/Get_Open_Babel
http://sourceforge.net/projects/openbabel/files/
http://openbabel.org/wiki/OBDotNet
http://sharperscience.blogspot.com/2008/12/introduction-to-obdotnet-part-1.html

■情報系
Chem-Station
http://www.chem-station.com/

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posted by w033 at 03:43| 東京 🌁| Comment(0) | TrackBack(0) | chem | このブログの読者になる | 更新情報をチェックする

chemical の語源

生きているうちに錬金術にかかわるとは思いもしませんでしたよ。
まあ、タイトルの通り、語源が錬金術なだけですが。
それでも、かかわるとは思っていなかったけどなー。

ケミカルとは?
http://d.hatena.ne.jp/keyword/%A5%B1%A5%DF%A5%AB%A5%EB

というわけで、最近ほんのちょっぴりだけ化学と付き合い始めました。
といっても、専門的な知識はコンピュータに偏っていて、化学知識は皆無なのですが。
Cheminformatics?

いや、あのへんな六角形を学校以外で見ることになるとはね。
脱塩ってなに? 中性化と何が違うの?
どっちもノーマライズですませちゃうのはなぜ?
ははは、まったく意味も知らずにLogPとかいじってます。
誰かが作った結果予想関数なんて意味もわかりませんけどねー。
ソースにコメントもないものを解析して直せなんて、バカかーーー!!
と、酒の勢いにまかせて、言ってみて〜〜〜。
飲めませんけど。

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posted by w033 at 03:05| 東京 🌁| Comment(0) | TrackBack(0) | chem | このブログの読者になる | 更新情報をチェックする